Zavodi su ustrojbene jedinice Fakulteta koje ustrojavaju i koordiniraju znanstveno - nastavnu i stručnu djelatnost.
 

Na Fakultetu postoje sljedeći zavodi:

• Zavod za antropološku kineziologiju - prof.dr.sc. Jelena Paušić
• Zavod za kineziologiju sporta - prof.dr.sc. Zoran Grgantov
• Zavod za kineziološku edukaciju i metodologiju - doc.dr.sc. Tonči Bavčević

Zadaci zavoda su: 

• da razmatra sva pitanja znanstveno-nastavnog i stručnog rada iz znanstvenih polja iz svoga djelokruga i poduzima potrebne inicijative za rješavanje problema pred nadležnim organima Fakulteta
• da utvrđuje znanstvenoistraživačke i stručne projekte
• da potiče i prati stručno i znanstveno usavršavanje nastavnika i suradnika Zavoda,
• da potiče izradu skripti i udžbenika,
• da utvrđuje planove sudjelovanja nastavnika na kongresima, simpozijima, studijskim dopustima
• da planira nabavku opreme i potrošnog materijala za potrebe zavoda.